Deutsche DVD-Release am 03. September 2007
In einer Einleitung des Filmes sehen wir, wie ein Meteorit am Nordpol herunterstürzt. Dabei fliegt der Meteorit an Rayquaza vorbei, welches gerade im Himmel herumflog. Als Rayquaza merkt, dass dies kein normaler Meteorit, sondern ein Pokemon war, wird Rayquaza wütend und greift den vermeindlichen Eindringling in seinem Gebiet an. Nach einem heftigen Kampf, der auch die lokale Forschungsstation komplett vernichtet, kann Rayquaza das Deoxys besiegen. Ein Teil von Deoxys fällt dabei ins Wasser und ein Stück Felsen mit einem "Ei" bleibt am Boden liegen.
Diese Ereignisse wurden von einem Kind namens Tory und seinen Eltern, beides Forscher in der Polarstation beobachtet. Unglücklicherweise spielte Tory gerade mit einigen Seemops, als der Kampf begann und wurde in all dem Chaos fast von einer Horde Seemopse überrannt. Dieses Ereignis sorgte leider für ein Trauma bei dem Jungen, so dass er von nun an Angst vor Pokemon (und deren Trainern) hat. Seine Eltern widmen sich weiterhin der Forschung, speziell nachdem sie die erstaunlichen Fähigkeiten des Deoxys sehen konnten. Dieses regenerierte sich im Kampf gegen Rayquaza nämlich. Aus diesem Grund nehmen sie das Ei mit in ein Labor einer großen Stadt...
Vier Jahre später treffen unsere Freunde, Ash, Maike, Max und Rocko in genau dieser Stadt, LaRousse City ein. Es ist eine High-Tech-Stadt bei der man direkt nach dem Aussteigen aus dem Zug von freundlichen Robotern begrüßt wird, automatische Fließband-Straßen einen überall hin bringen und auch sonst viel Luxus herrscht.
Wie sich allerdings zeigt, kann High-Tech auch verwirrend sein, da Maike und Ash jeweils kleine "Probleme" in dieser Umgebung haben. Bei Ash zeigt sich dies darin, dass er erst zu spät die Fließband-Straßen bemerkt und somit in die falsche Richtung zu fahren droht. Zum Glück - oder Pech (wie man es sieht), wird er von einem anderen Trainer namens Rafe und seinem Lohgock gerettet. Dieser macht sich von nun an aber über Ash lustig. Beide einigen sich allerdings darauf ihren Streit im Duellturm der Stadt beizulegen. Dies war ohnehin das Ziel von Ash in dieser Stadt. Dass er dabei auch Rafe, seine beiden kleinen Schwestern, Rebecca (die Rivalin von Rafe) sowie Sid (ein anderer Trainer) kennenlernt ist ein netter Nebeneffekt.
Im Duellturm angekommen will Ash sich gerade anmelden, als er auf den inzwischen älteren Tory trifft. Sobald Tory jedoch Pikachu sieht, läuft er panisch davon. Ash verfolgt ihn, da er ihn fragen will wo die Anmeldung zum Duellturm stattfindet, doch nach einer Aufzugfahrt landen beiden - wie es der Zufall so will - in der Arena und dürfen zusammen antreten. Die Anmeldung erfolgte, wie fast alles in LaRousse City automatisch über die Ausweise.
In der Arena erwartet Ash auch direkt eine neue Überraschung. Rafe und Sid, die er bereits auf der Fließband-Straße in der Stadt getroffen hatte, sind seine Gegner im Doppel-Teamkampf der Arena. Sein Partner ist... Tory.