Für alle die es interessiert, ich konnte mir die Frage jetzt über Discord beantworten lassen 😃:
Zu 1.
Es ist total egal ob dazwischen noch andere Pokis besiegt werden oder nicht.
Zu 2.
Es gibt keine Chain! D. h. Es zählt einfach nur, dass man 60 Pokemon einer Art an einem Tag egal wo besiegt haben muss um die Chamce zu steigern. Aufläufe bieten sich hier dafür einfach nur an, da dort besonders viele auftauchen.