Es handelt sich dabei nicht um einen Bug!!!
Wenn du die Trainer in deiner schwarzen Stadt nicht täglich ansprichst und mit ihnen kämpfst, verlassen sie die Stadt irgendwann - und mit ihnen "schrumpft" die Stadt. Außerdem werden die Items, die an den jeweiligen Trainer gebunden sind, auch aus dem Einkaufssortiment genommen.
Zurückholen geht nur bedingt: Du musst dich mit einem Freund übers C-Gear in die Kontaktebene begeben und so NPCs aus seinem Spiel in deines einladen. Diese bevölkern anschließend deine Stadt. Mit Glück schalten sie die von dir gewünschten Items auch frei.
Mehr als 10 NPCs können aber nie gleichzeitig in der Stadt sein.
Selbiges gilt ebenso für den Weißen Wald