Sehr spannendes Thema :D
Ich glaube, was mir gut gefallen würde, wäre tatsächlich mehr Indivudalität für den Spieler was z.B. die Erstellung des Trainers angeht. Und wenns erstmal nur ein paar einfache Frisuren zum Auswählen sind, Haarfarbe und Klamottenfarbe (muss nichtmal ein voller Kleiderschrank sein).
Vielleicht könnte man dem Trainer eine Möglichkeit geben, im Verlauf des Spiels mehr Sachen zu bekommen (z.B. hat man ja in einer Generation für die Wettkämpfe ein neues Kleid/Anzug bekommen) und diese auch mit der Hauptstory zu verbinden. Um auf die Party, wo der Oberbösewicht ist zu gelangen, sollte man einen Anzug besitzen.
Vllt könnte man dann auch mal ein Einkaufszentrum zur voller Blüte bringen :D Ich fand es schon immer merkwürdig, dass man alles bekommt aber keine Klamotten und ich bin weißgott keine Person die gerne Klamotten einkaufen geht.
Das Zimmer etwas individueller gestalten und auch mal benutzen können :D Ich finds immer merkwürdig, ein Zimmer zu haben, was man dekorieren kann, aber am Ende bringts eh nicht. Warum nicht ein Event, dass sich je nach Deko ein Pokemon durchs offene Fenster verirrt, welches man dann fangen kann.
Neue Fortbewegungsmethoden, die vllt auch Individuell angepasst werden könnten. Statt Fahrrad Inlineskates oder Skateboard. Die Möglichkeit an Land auf Pokemon fortzubewegen fände ich auch spanndend. Reiten oder ähnliches. Wenn dabei noch das Pokemon erkennbar wäre, wäre das sehr cool.
Wie von vielen schon angemerkt: mehr Sachen mit dem Wetter. Ich habe schon ein paar schöne Ideen gesehen :D Ich fänds auch spannend, wenn auch mal Eispokemon in Regionen auftauchen, wo sie nicht alltäglich sind, weil es eben gerade Winter ist. Käferpokemon sollte es im Winter eigentlich gar nicht geben - außer man schüttelt sie von Bäumen oder gräbt sie aus Löchern aus.
Ob ich mehr Einfluss im Kampf gut finde oder nicht, da bin ich mir selber noch nicht soo sicher. Wenn man aber Einfluss auf Pokemon in der Wildbahn möchte, muss man glaube ich auch ja zum Einfluss auf Kämpfe sagen.
Neue Pokemon würde ich übrigens nicht unbedingt brauchen. Ich würde gerne mal wieder was mit den alten machen, bzw mich mit den neuen mental besser anfreunden. Eine weitere Vernetzung von Städten, wäre nicht schlecht um eine größere Pokemonvielfalt zu ermöglichen. Hier könnte man vllt auch wieder individuell sein und selber aussuchen in welcher Region man gerne starten möchte.
Wenns unbedingt neue Pokemon braucht - warum nicht dem Trainer selbst überlassen neue Arten zu "entdecken" - zum Beispiel durch Zucht. Verschiede Farbvarianten (nicht nur Shinys) oder andere kleine Details die sich verändern. Ein paar Möglichkeiten um direkteren Einfluss auf die Zucht zunehmen :D einen Eier-Ultraschall umzusehen, was rauskommt oder so (wobei das dann vllt zu ethischen Fragen führt - das muss ja nicht sein)
mehr fällt mir jetzt erstmal nicht ein :D
Endlose Möglichkeiten - und uns bleibt nichts anderes übrig als uns überraschen zu lassen.