Also, um schon mal ein paar Fragen zu beantworten:
Wesen
Das Wesen gibt quasi den Charakter des Pokemon an. Im Spiel wirkt sich das aus, indem ein Wert des POkemon um 10% erhöht, und ein anderer verringerd wird, zB Angriff hoch und Initiative runter. Dann gibt es noch neutrale Wesen, bei denen passiert nichts. Eine Tabelle mit den Wesen findest du zB hier auf Bisafans: Tabelle
Entwicklung
Die Zeitpunkt der Entwicklung hat auf das Pokemon selbst keine Auswirkung. Es kann halt nur sein dass du bestimmte Attacken dann nicht lernst, weil die Vorstufe sie später gelernt hätte. ZB lernt Evoli in X/Y auf Lv 29 Charme, die Entwicklungen aber nicht. Entwickelst du Evoli schon vorher zu seiner neuen Entwicklung Feelinara, lernt es auf 29 statt dessen Nebelfeld, kann Charme also nicht mehr lernen. Das ist aber immer unterschiedlich.
Vitamine
Die Vitamine, also Kalzium, Protein usw erhöhen jetzt die EV um 10 Punkte, bis zu einem Maximum von 100. Danach kannst du sie nur noch über EV-Training erhöhen. Die sind mit X/Y "relativ" nutzlos geworden, da man die EV jetzt auch über das Supertraining sehr einfach antrainieren kann. Sind aber immer noch ein Zeitersparnis.
EV/DV
Die DV sind versteckte Werte, die quasi die "guten (oder nicht so guten) Gene" des Pokemons sind. Sie erhöhen das entsprechende Attribut auf Lv 100 um den jeweiligen Wert. Davor fließen sie bereits mit abnehmender Wirkung ein. Das Maximum eines DV-Wertes ist 31. Hat ein Pokemon also 30 DV auf Verteidigung, hat es auf Lv 100 30 Verteidigung mehr als ein Pokemon mit 0 DV in Verteidigung.
Im normalen Spielverlauf sind die aber nicht wirklich ausschlaggebend.
EV sind die Fleißpunkte des Pokemons und wurden jetzt mit XY sichtbar gemacht. Sie funktionieren ähnlich wie die DV, erhöhen aber den Wert auf 100 aber nicht 1:1 sondern zu 1/4. Die EV trainierst du indem dein Pokemon Erfahrung durch Kämpfe bekommt, wobei die EV vom Gegner abhängen. S bekommen alle POkemon die im Kampf Erfahrung erhalten zB 2 Angriff EV, wenn du ein Flamara besiegst.
Außerdem lassen sie sich über das Supertraining, Vitamine oder andere Möglichkeiten steigern.
Am besten schaust du zu DV und EV mal in der Trainerschule vorbei.
3DS und PokeBank
Für den 3DS muss man eigentlich nciht sonderlich viel wissen. Größtes Merkmal sind wohl der 3D-Effekt (der extrem viel Strom zieht 
) sowie das Hauptmenü. WLAN einrichten ist relativ simpel, der 3DS besitzt auch einen Assistenten dafür.
Du musst für dich selbst wissen ob dir die Pokemon das Geld für die Spiele wert sind. Spielen lassen sie sich auf dem 3DS auf jeden Fall. Sonst könnte man die Pokemon von dort ja gar nicht in die Bank schicken ;)
Änderungen.. oder auch nicht
Uff.. das sind einige. Die wichigsten, die mir jetzt spontan einfallen:
-EP-Teiler gibt jedem Pokemon im Team EP, wenn er eingeschaltet ist
-viiieeele neue Pokemon und neue Entwicklungsmethoden (zB Lv-Up an bestimmten Orte, oder den DS während der Entwicklung umdrehen.. wer hat sich das ausgedacht..?)
-der neue Typ Fee
-O-Kräfte, mit denen du zB deinem POkemon einen Angriffs-Schub geben kannst. Sie sind aber nur außerhalb von Kämpfen einsetzbar
-das Spielprinip grundsätzlich hat sich nicht geändert, Rundenbasierte Kämpfe, zufällig auftauchende Pokemon, Trainer, Orden, Top 4, alles noch da
Was anderes fällt mir jetzt spontan nicht ein.. Ich hoffe ich konnte zumindest einige deiner Fragen beantworten :)
Und bitte haut mich nicht wenn ein paar Fehler dabei sind, ich hab auch nicht die allergrößte Ahnung :D
in ein Team nicht so gut rein passt, bzw 
einfach stärker wäre. Vor allem da man eh meistens schon 
im Team hat.