Bei ihrer Reise durch die Orange Inseln treffen Ash, Misty und Tracy auf das U-Boot eines Karpador-Beobachters namens Quakenpoker. Natürlich nutzt Tracy die Chance und will einiges von ihm lernen. Gemeinsam begeben sich die vier auf die Insel, zu den alle Karpador schwimmen.
Auch Team Rocket ist natürlich wieder dabei, doch mit ganz anderen Plänen... Sie wollen alle Karpador fangen und zu Garados entwickeln. Mit dieser Armee aus Garados will Team Rocket dann die Welt beherrschen. Ob deren Plan klappen wird, erfahrt ihr gleich.
Der Professor und unsere Freunde besteigen inzwischen den Berg der Insel und beobachten dabei, wie die Karpador auch versuchen den See auf dem Berg zu erreichen. Allerdings schaffen nur die stärksten Karpador den Weg nach oben...