Ja, Pokémon können sehr wohl sterben.
1) Es gibt ja genügend Gebäude, die als Friedhof funktionieren-> Sei es jetzt der Pokémon Turm in Lavandia oder der Turm auf der Route südlich von Trostu.
Vor allem im Lavandia Turm jammern sie ja à la: "Ohhhhh mein fukano, wieso musstest du mich verlassen!? *schluchz"
Was dazu interessant ist, dass der Rivale in Feuerrot/Blattgrün wenn man im Turm gegen ihn kämpft auf einmal ein bestimmtes Pokémon nicht mehr im Team hat. In der vorletzten Etage des Turms begegnet man ja außerdem einem Geist, der die verstorbene Mutter eines Tragossos ist. (Siehe Pokémon Origins)
2) Lauro und Le Belle sind auch super Beispiele.
Lauros Pokémon ist ja an einer Krankheit gestorben und Le Belles Glibunkel ist auch gestorben
3) Kann die Welt der Pokémon so nicht bestehen wenn sich die Pokémon nicht gegenseitig töten und auffressen. Außerdem müssen die Menschen auch was anderes als Sinelbeeren und so essen. Man muss nur daran denken wie schnell es keine Beeren mehr geben würde wenn jedes Lebewesen, Mensch wie Pokémon nur Beeren essen würden.
4) Sind einige Pokédex-Einträge doch recht seltsam... Tragosso zum Beispiel, es trägt ja den Schädel seiner verstorbenen Mutter(!), was nicht nur sehr creepy ist, sondern nur eine weitere Tatsache, dass ein Pokémon sterben kann. Außerdem sind einige Pokémon so extrem vom Körperbau, dass sie einfach dazu ausgerichtet sind, andere Lebewesen zu töten- Galagladis Klingen sind sicher keine Deko.
5) Im Anime wird ja auch ab und zu erwähnt, dass Pokémon gefressen werden. (Relativ am Anfang aller Folgen, wo Ash ein Raupy gegen Tauboga einsetzt. "Vögel fressen Käfer!" )
6) Irgendwie müssen ja auch Geistpokémon entsehen. Nehmen wir mal Gramokles her, ein "lebendiges" Schwert. Damit ein Objekt zum Leben kommt braucht es einen Geist->da kommen jetzt die toten Pokémon ins Spiel. Geister sind ja sowas wie tote Menschen (oder auch Tiere), also wieso sollte das nicht auch beiPokémon so sein?
7) Die Story von X/Y zeigt btw auch, dass Pokémon sterben. (Das werde ich hier wegen der Spoilergefahr nicht genauer erklären.)
Es gibt also genug Beweise das Pokémon das Zeitliche segnen.
Die einzigen Pokémon die nicht sterben können sind wahrscheinlich Legendäre Pokémon und Geistpokémon. Vielleicht dann noch Stahl und Eispokémon, da bin ich mir aber nicht so sicher...