Mein Problem ist jetzt soweit nach zig Änderungen und Versuchen behoben. Ich habe in den persönlichen Notizen rumgespielt und den Guide dauernd geändert, schlussendlich habe ich dann jedes Pokémon und jede Tabelle einzeln in einen align-Befehl gepackt und den Quellcode so gut strukturiert, dass es kaum besser geht. Zwar tauchen nach Bearbeiten des Guides immer noch zig align-Befehle zwischen den Pokémon-Auflistungen auf, aber da ich jetzt den korrekten Quellcode des gesamten Threads in einer Notiz gespeichert habe und jederzeit ohne Probleme einfügen kann, ist das kein Problem. An dieser Stelle nochmal vielen Dank an @Sumpex, der mir den Guide gefühlt zehn mal zurückgesetzt hat, weil immer mehr Fehler auftraten. Wenn mich wer darüber aufklären kann, warum das so war/ist, kann er dies bitte gern dennoch tun, es war mitunter "dezent" nervig, dass dauernd neue Fehler auftraten.
Edit: Und die zahllosen Leerzeilen, die im ganzen Guide aufgetaucht sind, kommen zum Glück auch nicht mehr wieder.